В безлунную ночь на улицах Нью-Йорка Рю Хаябуса неожиданно становится мишенью для целого отряда наёмников. Преодолев преследование, он понимает, что их действия связаны с загадочной корпорацией Friedman Company, возглавляемой доктором Нед-Фридманом, который недавно потряс общественность заявлением об открытии лекарства от рака. Чтобы выяснить, зачем корпорация преследует его, герой направляется к жилищу учёного и там сталкивается со своей подругой-журналисткой Сарой, которая тоже ведёт собственное расследование вокруг таинственного доктора. Совместно они распутывают, каким образом Фридман шёл к своему открытию и как это тесно переплетается с прошлым самого Рю. В самый ответственный момент возлюбленная Хаябусы Айрин Лью оказывается похищенной неизвестными, и Рю вновь вынужден взять на себя роль Ниндзя-Дракона — чтобы спасти её и противостоять новой угрозе, нависающей над всем миром.
