В мире Альдноа.Зеро разворачивается грандиозное противостояние между Землей и Марсианской Империей. Всё началось в 1972 году, когда экипаж Аполлон-17 обнаруживает на лунной поверхности загадочные Гиперврата — устройства, открывающие путь к Марсу через телепортацию. Но помимо них земляне обнаруживают древнее наследие — импозантную технологию под названием Альдноа, чья мощь вскоре меняет расстановку сил. Освоив её, марсиане считают себя избранной расой и создают Империю Верс, а землян объявляют недостойными силы Альдноа и обречёнными на покорение. Так рождается конфликт меж двух миров, который вскоре перерастает в полноценную войну. Спустя десятилетия Верс наращивает армию и выходит на Землю. В ходе затяжного противостояния в 1999 году противники разрушают Гипервраты и сами ломают Луну, чьи осколки сыплются на Землю и уносят миллионы жизней. Перемирие становится вынужденной мерой, а марсианская империя вынуждена переселиться на орбитальные станции вокруг пояса обломков. Спустя пятнадцать лет принцесса Верс — внучка императора — отправляется на Землю с мирной миссией, но на её пути встаёт заговор, обещающий возрождение войны и новых потрясений для обоих народов.
