Шестьдесят лет назад, во время строительства плотины Куробэ, были обнаружены две загадочные реликвии, чьи уникальные свойства не поддавались объяснению учеными. Чтобы изучить их на месте находки, основали международный исследовательский центр под эгидой ООН — Куробэ. В его стенах собирались ведущие умы планеты, а их дети учились в международной школе Татэяма. Среди учеников значится Юкина Шираханэ — дочь руководителя института. Летом 2016 года город сталкивается с появлением странного самурая, сопровождаемого огромным боевым роботом по имени Куромукуро. Так начинается новая глава истории, в которой переплетаются научные тайны, судьбы героев и сложная гармония между людьми и мощной силой, скрытой в глубинах Куробэ.
