События разворачиваются в послевоенный период и начинаются в 1945 году, сразу после окончания войны на Тихом океане. Над землёй вторглись инопланетные захватчики, заполонив небо и навязав человечеству новую, неизбежную угрозу. Впервые народы всего мира объединились под единым знаменем, забыв старые разногласия ради выживания. Эта схватка тянулась полвека, опустошая города и унося бесчисленные жизни. Японские вооружённые силы оказались вынужденными полагаться на молодёжь вроде Ацуси Хаями и его товарищей по школе, сформированных в подразделение 5121. Именно это поколение принимает на себя основную тяжесть борьбы, неся бой с захватчиками, опираясь на передовые гуманоидные боевые машины HWT и разрушительные PBE-бомбы. Каждый бой проверяет их смелость, решимость и способность держаться вместе, ведь исход войны во многом зависит от их мужества и готовности к самопожертвованию.
