Кён — обычный японский школьник, привыкший к серым будням и тому, во что не верит ничего необычного. Всё меняется, когда в его классе появляется Харухи Судзумия: она уверена, что за пределами обычной школьной жизни прячутся пришельцы из будущего, инопланетяне и даже люди с особыми способностями — и все они выглядят как обычные ученики. Всё началось с её желания разнообразить школьную жизнь и найти действительно захватывающее занятие, которого не хватает в школе. Так рождается Бригада SOS — клуб по поиску и изучению паранормального. Первым членом после Харухи становится Кён, которому в тот момент хочется лишь одного — чтобы её энергия и шальная натура перестали тревожить его покой. Их базой становится комната литературного кружка, где уже обитает Юки Нагато — инопланетянка по происхождению. Но трёх человек мало; Харухи настаивает на расширении состава. Вскоре в команду входит очаровательная второклассница Микуру Асахина, путешественница во времени. Спешно появляется загадочный незнакомец с тайными мотивами, а вскоре к ним присоединяется Ицки Коидзуми — человек с паранормальными способностями. Так сформирован полный состав, и задача становится понятной: идти навстречу неизведанному, исследовать загадочное и влиять на ход событий, где неведомое прячется как в школе, так и за её пределами.
