Это аниме 1998 года, посвящённое истории Галактического экспресса 999: Вечная фантазия. Спустя время на Земле власть захватили люди, но от этого жизнь простых горожан не стала лучше: угнетение и произвол правящих кругов продолжают подпадать под сомнение многих. Тэцуро Хосино всё чаще высказывает своё недовольство существующим порядком и в итоге попадает за решётку. За его протесты ему грозит смертная казнь, однако на орбиту приближается Галактический экспресс с Мэйтел на борту, чтобы вырвать юношу из плена и спасти его. В ходе путешествия Тэцуро узнаёт, что за мрачной обстановкой на планете стоит могущественный Владыка Тьмы, и ставит себе задачу остановить его любой ценой ради судьбы Земли. Его путь переплетается с загадочным космическим кораблём и союзниками, которые помогают ему на каждом шагу. В финале он должен показать мужество и раскрыть свой собственный потенциал, чтобы дать планете шанс на будущее.