Действия одиннадцатого фильма о Детективе Конане разворачиваются посреди Тихого океана вокруг уединённого острова Коми. Здесь из поколения в поколение сохраняется легенда о Подводном дворце — древних руинах на морском дне, где, по верованиям, укрыты сокровища двух прославленных пираток: Энн Бонни и Мэри Рид, реальные фигуры прошлых трёх столетий. Во время отпуска на острове Когоро Морри, Конан Эдогава, Ран Мори и Команда юных детективов сталкиваются с охотниками за сокровищами и оказываются вовлечёнными в ряд запутанных событий. Вскоре герои вынуждены распутывать цепь преступлений, связанных с поисками спрятанных богатств, сталкиваясь с хитросплетениями лжи и интригам прошлого, чтобы предотвратить использование находок во вред и раскрыть тайны подводного дворца.
